研究发现遗传变异影响非洲裔患者的药物代谢

研究人员已经确定了影响非洲血统患者肝细胞基因表达的新遗传变异，根据发表在《美国人类遗传学杂志》上的一项西北医学研究，这些发现提供了对药物在不同人群中如何不同代谢的见解。

表达定量位点(eQTL)研究使用个体的基因组和转录组学数据来发现调节基因表达的独特遗传变异。然而，这些研究中使用的数据库历来代表性不足的非洲人后裔。

拥有这些全面的多组学数据是揭示调节个体基因组的机制和了解不同人群对药物的不同反应的关键，这可以改善治疗策略，根据Minoli Perera，PharmD，Ph.D.，药理学副教授和该研究的资深作者。

“我们没有来自任何历史上被排除在外的人群的数据来运行这些分析，所以我实验室的一大动机是在非洲血统人群中创建数据，以便他们在多组学中得到代表，”佩雷拉说，他也是西北大学罗伯特·H·卢里综合癌症中心的成员。

在目前的研究中，研究人员用六种FDA批准的药物处理了来自非裔美国患者的肝组织样本中的肝细胞 - 肝脏中的主要细胞类型：利福平(用于治疗结核病)，苯妥英(用于预防癫痫发作)，卡马西平(用于治疗癫痫发作，神经疼痛或双相情感障碍)，地塞米松(用于治疗炎症)，苯巴比妥(用于治疗癫痫)和奥美拉唑(用于治疗胃灼热和胃溃疡)。

然后，研究人员对用和不使用药物治疗的原代肝细胞进行了全基因组基因分型和RNA测序。他们还在肝细胞中绘制了影响基因表达的eQTLs或单核苷酸多态性(SNP)。

从这项综合分析中，他们发现了不同药物治疗中细胞系的不同转录变化，并确定NRF2作为潜在的基因转录调节因子。

“NRF2已经被确定为药物代谢的一个非常重要的转录因子，但这是一种更全面的方式来看待它，”佩雷拉说。

研究人员还发现了近3，000个遗传变异，这些变异会影响肝细胞对外部刺激的反应，包括药物，研究人员称之为药物反应eQTLs或reQTLs。值得注意的是，他们发现了药物代谢基因(如CYP3A5)的reQTL。